灵长目细胞内和对其有益的互利有机物的共同生命体引发了细胞内-有机物关系的其发展。表观遗传等位基因修饰使得灵长目蛋白并不需要整合外界环境接收器,促使蛋白对环境的适应性。但是一直以来互利的排泄有机物举例的多种接收器通路和多种环境接收器是如何仪器诱导的还不甚清楚。
排泄肝蛋白坐落有机物群和细胞内错综复杂的界面,促使更为重要一道的形成,在有益一时期和损伤一时期对排泄腺体开展必要。维持排泄肝蛋白其发展过程中但会有多种表观遗传等位基因功用参加其中但会,其中但会HDACs的隐含对于排泄一个系统非常更为重要。排泄有机物举例的短链脂肪酸磺酸皂(Butyrate)在体外抑止HDAC活性,磺酸皂处理后的排泄组织起来肝蛋白中但会HDAC活性回升。在未成熟狸中但会植入产磺酸皂的排泄有机物但会抑止排泄肝蛋白中但会HDAC的活性。这些结果都所述排泄有机物举例的磺酸皂抑止HDAC的活性。但是排泄有机物与扯氧核糖核酸扯烷基化肽活性错综复杂的诱导功用是怎样的还并不知道。
近日,英国辛辛那提儿童医院医疗中但会心Theresa Alenghat深入研究组在Nature周刊上发表文章 Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut,找到排泄有机物举例的脂类氨基皂并不需要抑止排泄内扯氧核糖核酸扯烷基化肽HDAC3的活性从而促使排泄肝蛋白的复原,揭开了细胞内对于排泄有机物接收器拥护的具体功用。
为了揭开排泄有机物衍生生物合成催化反应与表观遗传等位基因接收器错综复杂的关系,所写们对野生改型以及排泄肝蛋白HDAC3敲除血清中但会的HDAC活性进性探测,找到野生改型结果表明血清中但会的HDAC3隐含短时间并且有着平稳的肽活性,但是排泄肝蛋白HDAC3敲除血清则反之亦然。所写们就让告诉HDAC3是否但会特异性抑止排泄有机物敏感的接收器功用于。所写们找到HDAC1与HDAC2在排泄肝蛋白中但会也有隐含,但并不能补偿排泄肝蛋白中但会HDAC3隐含的缺失。而且在对未成熟狸和排泄肝蛋白HDAC3敲除血清中但会的排泄肝蛋白施以HDAC广谱衍生物处理后,找到在HDAC3敲除后其他多样的HDACs仍然有着活性。这些结果所述排泄有机物促使肝蛋白中但会HDAC3在短时间排泄一个系统中但会的肽活性。
为了破译排泄有机物激活HDAC3的具体功用,所写们对未成熟狸和短时间培养的血清中但会排泄肝蛋白中但会的转录谱开展验证。所写们找到在排泄有机物实际上的肝蛋白中但会与脂类氨基生物合成相关的等位基因被广泛功用于隐含。古人的深入研究找到脂类三氨基(Inositol trisphosphate)但会通过精进HDAC3与激活蛋白的相互功用来提高HDAC3的活性。所写们找到外加脂类三氨基的确但会特异性提高HDAC3-NcoR重扯氧核糖核酸的活性,NcoR蛋白对于HDAC3的扯烷基化肽活性非常更为重要。
再进一步地,所写们就让告诉未成熟狸与结果表明的血清排泄错综复杂脂类三氨基水准是否实际上关联性。所写们找到结果表明血清中但会无论是肠腔还是排泄肝蛋白中但会脂类三氨基的水准都许多现代高于未成熟狸,所述排泄有机物的实际上促使脂类三氨基水准的提高。为了评估脂类三氨基对于排泄肝蛋白中但会HDAC3活性的影响,所写们对排泄肝蛋白中但会的HDAC3蛋白开展纯化并与脂类三氨基开展共同孵育,找到脂类三氨基的确并不需要提高内源HDAC3的活性。而且磺酸酮造成的HDAC3活性的抑止也可以被脂类三氨基所骨骼肌。另外,所写们还找到互利的排泄有机物但会通过脂类六氨基(Phytate)生物合成间接地促使排泄肝蛋白中但会的HDAC3的功用。与脂类三氨基相似,脂类六氨基也但会功用于排泄肝蛋白中但会的HDAC3的活性。
为了探测排泄有机物脂类六氨基依赖的生物合成对于HDAC活性的影响,所写们对定植野生改型以及脂类六氨基肽缺失改型菌株的血清开展分析方法。所写们找到定植脂类六氨基肽短时间隐含菌株的血清相对于于未成熟狸以及脂类六氨基缺失改型菌株血清的脂类三氨基水准急剧下降。对血清开展右旋糖酐碳酸酮锂(Dextran sodium sulfate, DSS)处理后,但会功用于血清转化成排泄结核病。为了探测脂类三氨基在DSS处理功用于的排泄结核病中但会的功用,所写们对未成熟狸施以脂类三氨基后找到脂类三氨基并不需要促使排泄从结核病中但会恢复并提高未成熟狸的寿命。DSS功用于的大肠类似于病患中但会溃疡性大肠。为了再进一步证实排泄有机物生物合成催化反应的功用,所写们对生命整合有机物组学计划(Integrative Human Microbiome Project)中但会的有益样本以及溃疡性大肠高血压的样品开展探测,找到在溃疡性大肠病患排泄中但会脂类六氨基肽的原子量已远低于有益样本之下但会,所述脂类六氨基对于排泄损伤复原是不能的。
总的来说,Alenghat深入研究组的工作找到相对于于未成熟狸,排泄有机物实际上的血清中但会HDAC3活性许多现代降低,这一降低是通过互利的排泄有机物比如菌株脂类六氨基以及脂类三氨基的生物合成形成的。另外,脂类三氨基但会功用于病患举例的排泄类器官的生长、刺激HDAC3依赖的蛋白增殖以及骨骼肌磺酸酮引起的排泄生长抑止,但会促使排泄结核病中但会肝蛋白的复原。因此,所写们鉴定找到了HDAC3作为细胞内拥护多种排泄有机物接收器的汇聚表观遗传等位基因因子的重要功用,揭开了排泄有机物、表观遗传等位基因因子以及有机物生物合成催化反应在排泄腺体以及排泄结核病中但会的重要诱导和复原功用。
原始出处:
Shu-En Wu, Seika Hashimoto-Hill, Vivienne Woo, et al.Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut.Nature. 2020 Jul 30. doi: 10.1038/s41586-020-2604-2.
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